Mantra diksha je sveta inicijacija u mantra meditaciju. 

Proces mantra dikshe uvijek se izvodi individualno i uživo, uz ritual Puje koja pripada određenoj mantri. Sastavni dio procesa uključuje dodir na treće oko-Ajna čakru i zatim se mantra, tri puta, tiho šapne u uho. Na takav način izvrši se energetska transmisija u živčani sustav čovjeka i mantra se aktivira.  

Prva diksha Shiva Shakti Tantre je u Guru tj. korijensku mantru Om Namah Shivaya. Pri ovoj mantra dikshi izvodi se Shiva Puja. Uz mantru se dobiva i rudraksha japa mala–brojanica koja služi za mantra japa meditaciju.  

Guru mantra može se koristiti na dva načina. Jedan način je sjedeća meditacija sa japa malom, dok se drugi odnosi na mentalno izgovaranje mantre u bilo kojoj dnevnoj aktivnosti, što se naziva ajapa japa. Na takav način čuva se mir uma, biva se otporniji na sve stresove koje život nosi i živi se uronjen u sadašnji trenutak.

Pri ovoj prvoj mantra dikshi dobiva se dnevna meditacija koja se sastoji od 11 japa mala, za što je potrebno tridesetak minuta. Kasnije se duljina meditacije može povećavati u skladu sa kapacitetom i mogućnostima čovjeka. 

Druga diksha je u Mahamrityunjaya ili Tryambakam mantru, koja se popularno zove i mantra besmrtnosti. Pri ovoj mantra dikshi izvodi se Shiva Puja. Ovo je vrlo intenzivna mantra i za početak se dobiva samo jedna japa mala mantre dnevno, za što je potrebno dvadesetak minuta. Polako, uz redovnu mantra japa meditaciju, ovaj dnevni broj japa mala se povećava.

Mahamrityunjaya je prva, od dvije, koja ima ulogu kshetrapal mantre (kshetra – sveto mjesto; pal-zaštitnik). U Shiva Shakti Tantri sveto mjesto je ljudsko tijelo. U njemu će živjeti probuđena Kundalini Shakti. Takvo tijelo mora biti snažno, a um stabilan i neustrašiv da bi moglo doći do utjelovljenja tako silne energije. To je domena kshetrapal mantri. Druga takva mantra je Bhairav mantra. Ona je mnogo potentnija od Mahamrityunjaya mantre. Do ove dikshe dolazi se mnogo kasnije, prije ulaska u suptilne dijelove Shakti Tantre, kada dolazi do otvaranja viših čakri.

Om Namah Shivaya i Mahamrityunjaya mantre temeljna su praksa Shiva Shakti Tantre. One će, kroz redovnu mantra japa meditaciju, očistiti suštinske strahove koji se nalaze u svakom čovjeku. Uklonit će veliki dio osobne negativne karme, kao i karme cijelog obiteljskog stabla. Sve ove promjene bit će jasno vidljive u manifestiranom svijetu, našem izvanjskome životu. One  će buditi i intuiciju, obilje energije u tijelu i Kundalini Shakti. Budit će mnogo devocije i srčanosti (bhakti). Čistit će i smirivati mentalnu aktivnost, povećavati fokus i koncentraciju, iscjeljivati i stabilizirati emocionalno tijelo. Mantre će podariti mnoge uvide o prirodi svijeta u kojem živimo, povezat će čovjeka sa najdubljim aspiracijama njegove duše i dati mu snagu da ih slijedi.

Potrebna je svakodnevna redovna mantra japa meditacija, minimum godina dana sa Om Namah Shivaya mantrom, prije dikshe u Mahamrityunjaya mantru. Vrijeme trajanja meditacije sa ovom mantrom je potpuno individualno. Ovisi o predanosti pojedinca cijelom procesu, zrelosti i količini mentalno-emocionalne prtljage koja se mora očistiti.

Nakon što je meditant prošao kroz mantra japa meditaciju sa Om Namah Shivaya i Mahamrityunjaya mantrama, spreman je za intenzitet kojeg donosi Shakti Tantra.